Serwis Polskiego Towarzystwa Genealogicznego

flag-pol flag-eng home login logout Forum Fotoalbum Geneszukacz Parafie Geneteka Metryki Deklaracja Legiony Straty
czwartek, 05 grudnia 2024

longpixel


Napisz nowy temat   Odpowiedz do tematu
Zobacz poprzedni temat Wersja gotowa do druku Zaloguj się, by sprawdzić wiadomości Zobacz następny temat
Autor Wiadomość
lukaszppOffline
Temat postu: Imputacja danych  PostWysłany: 31-12-2023 - 14:21
Sympatyk


Dołączył: 09-12-2018
Posty: 17

Status: Offline
Witam,
Zrobiłem sobie test FTDNA, przeanalizowałem sobie, pobawiłem się trochę wynikami i samymi danymi, świetna sprawa, polecam.
Ale z innym pytaniem - spotkałem się z tzw. DNA Imputation - czyli "matematycznym" "poprawianiem" i "rozszerzaniem" badania DNA.
Czy ktoś może próbował jak to działa w praktyce?
Konkretnie rozważam ich usługę: https://www.dnagenics.com/products/imputation

_________________
Łukasz P.
 
 Zobacz profil autora Wyślij prywatną wiadomość  
Odpowiedz z cytatem Powrót do góry
swigutOffline
Temat postu: Re: Imputacja danych  PostWysłany: 01-01-2024 - 02:54
Sympatyk


Dołączył: 08-05-2022
Posty: 108

Status: Offline
lukaszpp napisał:
Witam,
Zrobiłem sobie test FTDNA, przeanalizowałem sobie, pobawiłem się trochę wynikami i samymi danymi, świetna sprawa, polecam.
Ale z innym pytaniem - spotkałem się z tzw. DNA Imputation - czyli "matematycznym" "poprawianiem" i "rozszerzaniem" badania DNA.
Czy ktoś może próbował jak to działa w praktyce?
Konkretnie rozważam ich usługę: https://www.dnagenics.com/products/imputation


Imputacja polega na zgadywaniu alleli które nie były uzwględnione w badaniu na podstawie innych alleli które były uwzględnione. Pozwala to np. na porównanie pokrewieństwa pomiędzy osobami które miały testy na innych platformach. Imputacja nie jest dokładna ale lepsza niż nic.
Imputacja działa ponieważ blisko siebie położone zmiany w kodzie genetycznym rzadko są rozdzielane procesem rekombinacji, tzn np. w populacji w pewnym miejscu w genomie jest bardzo częste są alternatywne kombinacje A..C..A..T i T..G..C..A, a inne kombinacje alleli są bardzo rzadkie. Firma pierwsza np patrzy na pierwszą i trzecią pozycje, firma druga na drugą i czwartą. Więc bezpośrednio nie można porównać wyników. Ale ponieważ firma 1 widziała A i A to można zgadnąć ,że w teście drugiej firmy będzie C i T.
Istnieją darmowe programy open source, które wykonują imputację, ale wymagają pewnego wysiłku w nauczenie się obsługi. Z firmą dnagenics nie mam doświadczenia.
Firmy które biorą wyniki z różnych źródeł stosują imputację. W praktyce zwiększa to ilość fałszywych pozytywnych wyników, ale pozwala na wykrycie pokrewieństwa z większą czułością między platformami.

Tomek
 
 Zobacz profil autora Wyślij prywatną wiadomość  
Odpowiedz z cytatem Powrót do góry
Wyświetl posty z ostatnich:     
Skocz do:  
Wszystkie czasy w strefie CET (Europa)
Napisz nowy temat   Odpowiedz do tematu
Zobacz poprzedni temat Wersja gotowa do druku Zaloguj się, by sprawdzić wiadomości Zobacz następny temat
Powered by PNphpBB2 © 2003-2006 The PNphpBB Group
Credits
donate.jpg
Serwis Polskiego Towarzystwa Genealogicznego zawiera forum genealogiczne i bazy danych przydatne dla genealogów © 2006-2024 Polskie Towarzystwo Genealogiczne
kontakt:
Strona wygenerowana w czasie 0.307983 sekund(y)