Genealodzy.PL Genealogia

Genealogia genetyczna - Jaki test wykonać?

podkarpacie - 11-03-2020 - 21:06
Temat postu: Jaki test wykonać?

Witajcie,
Zrobiłem prosty test YDNA-12 i uzyskałem informację, że należę do haplogrupy R-M198

http://i.paste.pics/b3936fd5eaae6dfc145 ... b3fe30.png

Jaki powinienem zrobić kolejny test, aby sprawdził np. osiem mutacji kolejnych i np. dał wynik YP256?

Y37, Y67 czy już powinienem wykonać test SNP dla M198?

Próbka jest w FTDNA - o ile ma to znaczenie...

Z góry dzięki
Radek

Sroczyński_Włodzimierz - 11-03-2020 - 22:14
Temat postu: Jaki test wykonać?

z FT-DNA Y-12 raczej nie wyszła R-M198...może jakieś przewidywanie SNP
sprawdź czy w matchach nie masz bliskiego z już określoną "młodą" grupą, wtedy możesz czymś się kierować przy
http://poczekalnia.genealodzy.pl/pliki/ ... _PACKi.ods

kwestia budżetu...Big-Y 700?

podkarpacie - 12-03-2020 - 23:26
Temat postu:

Witaj Włodku,
Dziękuję za odpowiedź.

Tak naprawdę genealogia genetyczna to raczej ciekawostka dla mnie, a nie główne źródło badań i traktuje ją bardziej jako dodatek do spisywanej księgi rodowej, dlatego też nawet przewiadywania będą interesujące.

Niemniej jednak, widzę że masz wiedzę w tym temacie i jeżeli mogę liczyć na trochę wyjaśnień to byłbym wdzięczny.

Zacznę od tego że na FTDNA, wprawdzie znalazło mi matche ale osób totalnie nie znam, przeglądałem ich drzewa ale nic wspólnego nie znalazłem...

Ale.. przeanalizowałem zebrane dane i przedstawiają się one następująco:
https://i.paste.pics/96c08453fe840de467 ... 60da8f.png

Na żółto podałem ilość match'ów.

No i teraz kilka pytań:

1) Czym jest M512? Szukałem informacji na ten temat i znalazłem że w zależności od "organizacji" nazwa przybiera różną wartość https://www.geni.com/projects/R-M17-Y-DNA/3819 czy to prawda? W związku z tym mogę przypuszczać, że M198 i M512 to to samo?

2) Patrząc na wyniki, mogę zakładać, że należę do L1029 (na zielono)?

3) Zapisałem się do projektu R1a, ale przeglądanie całej listy w celu odszukania siebie jest bardzo kłopotliwe... jest na to jakiś szybszy sposób?
https://www.familytreedna.com/groups/r-1a/dna-results

4) Big-Y poza moim zasięgiem finansowym niestety.. ale powiedz mi proszę, jakie teoretycznie da mi wyniki np Y-67? Dotrę np. do R-M417 czy może R-Z283 a może dalej? Czy nie da się tego w żaden sposób określić?

5) Czym są badania SNP? Służą do upewnienia się czy haplogrupa wynikająca z testu np. Y67 jest prawidłowa, czy daje jakieś inne dane?

Z góry dzięki
Radek

Sroczyński_Włodzimierz - 13-03-2020 - 00:00
Temat postu:

12, 37, 67 obojętnie jakie cyferki - nie badają SNP, nie badają haplogrup*

ale jeśli ktoś (match:) bliski Tobie (Twojej próbce) ma określoną SNiPem haplogrupę - z dużym prawdopodobieństwem sukcesu możesz zdecydować się SNP-Pack schodzący głębiej

co to daje?
przez poznanie nowego "singla" (nowa haplogrupa) określenie kiedy (ile pokoleń - > szacowanie czasu) mutacja wystąpiła - czyli kiedy (przez szacowanie ile pokoleń->szacowanie kiedy) dana gałąź się wyodrębniła (jeden syn zmutował, inny nie)
a jak "tylko" przez PACK (badają znane) to poznanie punktu podczepienia w istniejącym ( patrz np https://www.yfull.com/tree/ ), rozpoznanym, w miarę pewnym "drzewku"

co to da? a to popatrz które mutacje są uwzględnione w PACKu konkretnym- jak bardzo odległe od "czasu obecnego" ( AD 1950)

na ogół ze standardowego zestawu nie dojdziesz do "metrykalnego okresu", nie będzie wspólnego zbioru, przejścia z jednego do drugiego

no i ..choć temat omijany skrzętnie (niewiele osób podjęło się skonfrontowania z niewygodnymi faktami): SNP a STR czasami nie są zgodne - tj bywa, że sprzyjają rozłącznym, a nawet sprzecznym hipotezom
co świadczy, że założenia do wnioskowania nie są pełne lub nie są należycie uwzględnione przy najpopularniejszych wnioskowaniach (czytaj: drzewo wygląda jednak inaczej:)

a co w ogóle chcesz osiągnąć badając jedną próbkę? Bo to najbardziej istotne

*wyjątek bigY - nie tylko 700 STRów, ale i SNP przy okazji w pakiecie, ale to dzięki nie powtórzeń STR a pojedynczych zmian SNP, czyli co innego i gdzie indziej występujących, ale od tego i pełnego sekwencjonowania odchodzę w odpowiedzi, jako niespełniającego Twoich założeń

z wyników widać, że trochę pożałowałeś (czasu na czytanie choćby i naszego skromnego działu) ew. pieniędzy :) Y-12 jednak za mało selektywne - 37 STRów to minimum, pełna zgodność na 12 STRach z Y28674 (młody subklad) nie musi oznaczać wspólnego przodka odległego 10-13 pokoleń , gdyby taka zgodność była przy 67 albo 37...o to już coś!

expat - 13-03-2020 - 02:16
Temat postu:

Radek,

Y-DNA testy dotyczą tylko ojcowskich przodków. Tak więc szanse znalezienia czegokolwiek wspólnego w drzewach genealogicznych twoich Y-DNA dopasowań (matches) są praktycznie żadne, chyba że dane dopasowanie (match) ma takie samo nazwisko jak ty. Po prostu ty zapewne nosisz nazwisko swojego ojca, on nosi/nosił nazwisko swojego ojca, itd. Jeżeli nazwisko jest inne, to te DNA pokrewieństwo jest z czasów kiedy ludzie nie mieli nazwisk, tj. setki albo tysiące lat temu. Oczywiście mogą też być wcześniejsze przypadki męskich potomków ze związków pozamałżeńskich albo zmian nazwisk, ale udowodnienie takich przypadków prawdopodobnie nie ma dużych szans też.

Jeśli natomiast interesuje cię dokładniejsza pozycja twojej Y-DNA haplogrupy w haplogrupowym drzewie to najlepiej zwrócić się o poradę do administratora twojej haplogrupy na FTDNA. On/ona patrząc na twoje wyniki może ci powiedzieć jakie dalsze testy mają sens w twoim przypadku.

Pozdrowienia,
Krzysztof

domislaw - 13-03-2020 - 03:19
Temat postu:

Radku,

na Twoim miejscu zaryzykowałbym i zamówił na FTDNA szczegółowy test dla poszczególnych SNP dla haplo R1a:

R1a - Backbone SNP Pack

Koszt to 119$.

Poniżej lista SNP jakie sprawdza:

M420, M459, M198, Z283, Z280, CTS1211, CTS3402, M458, CTS11962, L260, Z284, L448, CTS4179, Z287, CTS8277, Z93, Z94, L657, F1345, L664, PF7521, Z281, Z282, M417, L1029, YP276, YP386, S4458, S5153, Y2905, Y4135, YP414, YP254, YP256, YP263, YP416, YP417, YP445, YP556, S6842, YP355, Y4459, Z685, Z92, YP582, S24902, YP340, YP343, YP1034, YP234, YP951, YP237, CTS8816, Y33, Y2613, Y35, YP1178, YP1368, YP398, YP704, YP441, YP1014, YP4243, S2857, S23592, Y14244, YP4131, CTS1733, YP1129, YP4123, YP358, Y5992, PF6155, Y2604, YP1570, YP4557, YP517, Y2395, YP3927, YP610, YP4517, S23201, YP285, YP1168, YP1137, CTS4385, YP418, Y934, YP942, YP1015, Y874, YP654, YP1364, YP515, Y2921, YP4132, YP1136, Y2914, YP4141, YP1051, FGC9988, YP544, S2880, YP432, YP431, YP442, YP1211, YP360, YP430, PF6162, Y40, Z2123, YP520, YP589, YP415, YP443, YP3896, YP1182, YP870, YP451, Y47, YP4519, YP4535, YP4101, YP4467, YP1272, YP694, YP1341, Y57, YP4514, YP1567, YP593, YP1703, YP1337, S3477, YP543, YP4102, YP1214, YP943, S2859, YP621, Z2122, YP413, Y17491, YP729, CTS8746, S3473, YP547, S2858, Y15121, YP1013, YP728, Z2035, YP541, S2894, YP4444, YP282, YP4515, YP444, YP559, M2747

Dla zobrazowania link do mapy kladów R1a:

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/cb/Aryan_migration_map_and_haplogroup_tree.jpg

Pozdrowienia,
Krzysio

Sroczyński_Włodzimierz - 13-03-2020 - 08:11
Temat postu:

nie widzę potrzeby przy matchach już teraz sięgających głębiej niż ogólny PACK wydawać 119 USD na PACK, to drożej niż rozszerzenie z Y-12 do Y-37 a tyle samo co Y-37 dla próbki potomka męskiego innego przodka (syna/dziadka dziadka matczynego?) / przodka (dziadka matczynego)

https://genealodzy.pl/PNphpBB2-viewtopic-t-80512.phtml

Patrykmatal10 - 23-09-2023 - 04:47
Temat postu:

Witajcie,
na wstępnie muszę dodać, że dopiero raczkuję w tematyce genealogii genetycznej, więc byłbym bardzo wdzięczny za w miarę możliwości prosty jeżyk w ewentualnych odpowiedziach Very Happy

. Korzystając z usług firmy familytreedna zrobiłem testy dna-37i uzyskałem informację, że należę do haplogrupy R-M198. Chciałbym sprawdzić kolejne mutacje. W podobieństwach Y-DNA Matches wyskoczyła mi osoba o haplogrupie R-M417. Tyle że on wykonał test Y-DNA111, a nie Big-Y 700. Moje pytania są następujące.
1. Jaka jests szansa, że ja także dziedziczę mutancie R-M417?
2. W celu poznania dalszych mutacji polecacie zamówić szczegółowy FT DNA test dla poszczególnych SNP, czy bez droższego Big-Y 700 się nie obejdzie?

Pozdrawiam, Patryk

Sroczyński_Włodzimierz - 23-09-2023 - 10:27
Temat postu:

Jak poprzednio , tak i teraz mam wątpliwości co do informacji o haplogrupie przy teście STR.
To raczej szacowanie, nie wynik badania SNP, czyli pośrednie wnioskowanie. Czyli mniej więcej to, co Ty próbujesz zrobić z przejścia z typowania jakiegoś Y-111 do Twojego, tylko "oczko wyżej".

Jeśli kryterium budżetu najistotniejsze, to raczej poza FT trzeba wyjść - te oferty od lat stanęły, nie uwzględniają zmian jakie zaszły na rynku i możliwości pełnych badań gdzie indziej

sirdaniel - 23-09-2023 - 11:04
Temat postu:

Myślę, że może Pan się opierać na danych FTDA odnosnie głównej haplogrupy M198. Jest to tak ogólna haplogrupa, że w tych się FTDNA nie myli.

Test dla tylko jednego SNP robi się dla bardzo szczegółowej haplogupy terminalnej.

SNP packi w FTDA jest produktem przestarzałym, ale można je kupić ale tylko wtedy kiedy wiesz "mniej więcej" do jakiej szczegółowej gałęzi należysz (będzie też taniej) i wtedy, gdy masz dużą ilość przetestowanych w tej gałęzi (własnie dobrze wiedzieć do której szczegółowej gałęzi nalezysz). Peneralnie jesli ktos jest faktycznie ciekawy, to zawsze po SNP pack jest niedosyt. No ale jesli ktoś ma tylko tyle pieniędzy, nie więcej, to też jakies wyjscie.

Najtańsza opcja na świecie to 18$ za pojedynczy SNP w Yseq.

Łucja - 23-09-2023 - 13:06
Temat postu:

Patrykmatal10 napisał:

1. Ciekawe jakie i ile masz matchy (12, 25 i 37 markerów)? Jak masz matche, które wykonały test BIG-Y700 to możesz ostrożnie szacować któryś z tych wyników dla siebie (często się to sprawdza).

2. Polecam BIG-Y700, zdecydowanie, potem wgranie pliku do YFull i wiesz obecnie wszystko co można dzisiaj wiedzieć.

3. Jak nie w tej chwili to jest/będzie inna ścieżka żeby uzyskać informację o SNP. Wykonaj w FTDNA test FamilyFinder, powinni Ci obecnie (albo już niedługo) JEDNOCZEŚNIE podać to SNP (coś wstępnie, ogólnie, nie bardzo wiemy co). Były na ten temat ich informacje, miało to być już teraz, ale się przesunęło, śledź temat. Możesz też do nich napisać i zapytać czy jak zrobisz FamilyFinder (test autosomalny) to już dostaniesz to SNP. Tyle, że ta ich oferta to ma być po prostu zachęta do wykonania testu BIG-Y.

A jakieś inne testy oprócz Y-37 w FTDNA wykonałeś?

Łucja

Patrykmatal10 - 23-09-2023 - 13:38
Temat postu:

Czyli trzeba było zrobić od razu Big-Y 700. Na familytreedna cena takiego testu wynosi 339 dolarów. Przed zakupem chciałbym się upewnić czy takie badanie napewno doprawadzi mnie do tych blizszych mutacji jak np. yp265? Jakie dodatkowe mozliwosci daje przeprowadzenie takiego testu ?

Korzystając z okazji chciałbym tez poprosić o jakiej artuykuły i opracowania na tej historii R1a M198.

http://www.historycy.org/index.php?showtopic=134316

znalazłem na przykład cos takiego, tylko ciekawe czy przy tak dynamicznie rozwijającej sie gałęzi nauki opracowania z 2015 roku są jeszcze aktualne Very Happy

Pozdrawiam, Patryk

sirdaniel - 23-09-2023 - 13:47
Temat postu:

To czy masz mutację yp265 czy nie nie wiemy, więc nie wiemy, czy cie tu test doprowadzi.

Test BigY jest szczegółowy i doprowadzi cię do najniższej możliwej haplogrupy jaka jest mozliwa w danej chwili. Bo ona tak naprawdę zalezy od tego, ile bliskich krewnych się przebadało. Zaleta Bigy nad SNP packie jest to, że będziesz mógł tworzyc nowe gałęzie, rozdzielać itp. Raz kupisz i spokój do końca życia.

Łucja - 23-09-2023 - 13:59
Temat postu:

Patrykmatal10 napisał:

Pozdrawiam, Patryk

Black Friday już blisko, a poza tym promocje cenowe są często. Nie zapominaj o FamilyFinder, tam są (i będą bardziej szczegółowe) informacje o haplogrupach matchy.

Z tym BIGY to jest coś takiego, że teraz może i warto robić od razu, ale kiedyś nie było BIGY, mój Ojciec startował od Y-37, potem zrobił Y-67, a dopiero później kuzyn uzupełnił do BIG-Y.

Łucja

Patrykmatal10 - 24-09-2023 - 00:54
Temat postu:

sirdaniel napisał:

Ciekawość wzięła górę i zamówiłem zestaw Big-Y 700. Przekonałeś mnie argumentem, że raz kupisz i spokój do końca życia. Very Happy

Teraz trzymam kciuki, żeby badanie doprowadziło mnie jak najbliżej czasów metrykalnych. Niesamowite jak wiele możliwości daje nam obecnie nauka, jeśli chodzi o genealogię genetyczną. Jestem bardzo ciekawy jak to będzie wyglądać za 10,20,50 lat. Jestem pewny, że drzewo genealogiczne ludzkości odkryje przed nami wiele sekretów.

Patrykmatal10 - 24-09-2023 - 19:35
Temat postu:

Cały czas odkrywam mozliwości strony familytreedna, W opcji Advanced Matches natrafiłem opcje odległości genetycznej między przebadanymi użytkownikami,

Na podstawie odległości genetycznej wynoszącej 4 na poziomie testu Y-37 szacuje się, że X i pan Y mają wspólnego przodka w linii ojcowskiej, który z 95% prawdopodobieństwem urodził się między 650 a 1750 rokiem n.e. Najbardziej prawdopodobny rok zaokrągla się do 1300 roku n.e. Data ta jest szacunkowa, oparta wyłącznie na informacjach genetycznych.
Pan Y testował na poziomie Y-111, który jest bardziej szczegółowy niż poziom Y-37. Możesz uaktualnić do tego samego poziomu, aby uzyskać lepsze oszacowanie czasu.

Czy po badaniu Big Y szacunki tych odległosci staną sie bardziej dokladne i precyzyjne?

Sroczyński_Włodzimierz - 24-09-2023 - 19:44
Temat postu:

przy 4 dla Y-37?
niekoniecznie, nawet bardziej niż "raczej nie"

i zdecydowanie lepiej jednak szacować w ilości pokoleń niż latach

Patrykmatal10 - 24-09-2023 - 20:09
Temat postu:

Użytkownik, z którym się porównuje ma Y-111, ja czekam na wyniki Big Y.

Jaką przyjąć średnią na pokolenie -25, 30 lat?

Korzystając z Twojej wiedzy i doświadczenia w tym temacie-podpowiedz, proszę czy na tej stronie znajdę aktualna wiedzy dotycząca haplogrup, czy mógłbyś polecić inne źródło.

http://www.tropie.tarnow.opoka.org.pl/p ... rzak.htm#6

Sroczyński_Włodzimierz - 24-09-2023 - 20:24
Temat postu:

chodzi mi o dystans
4
to nie jest blisko, poszczególne markery różnią się częstością mutacji, więc teoretycznie wprowadzenie innych STRów może coś dać ale nie liczyłbym na to przy 4..tzn szansa jest - jak widzisz "za tabelki" - może reszta bardzo zgodna i akurat te własnie z "37" się różniły "na odległość 4"

jak (tzn jeśli) dostaniesz SNP ..a niekoniecznie dostaniesz, bo big to STR+ zestaw SNP, a nie pełny skan (choć cena to powyżej pełnego skanu dostępnego poza FT) ...to można budować na Yfull (tzn podpinać się pod istniejące, raczej z bigY dużo nie uzupełnisz)

"datowanie" - to FT zmienił "sposób prezentacji" z poprzedniego: szacowanej ilości pokoleń (i paru innych narzędzi) do obecnego IMO gorszego, dającego mniej możliwość a i bardziej dyskusyjnego

za często "były raportowane", a jednocześnie za rzadko zanalizowane różnice pomiędzy STR i SNP, takie które prowadzą do sprzecznych wniosków by bazować na STR-ach
to raczej wskazówka i szukanie blisko
SNP (ale raczej z pełnego skanu) to już szerzej, głębiej, inna baza (aDNA!)..poczekaj na wyniki

Patrykmatal10 - 27-09-2023 - 03:49
Temat postu:

Łucja napisał:

Patrykmatal10 napisał:

Przepraszam, przeoczyłem pytanie. Robilem test autosomalny na myheritage, Y-37 na family i czekam na wynik BIG-Y na family.
Jeśli chodzi o matchy to znalazłem 3 chyba warte zbadania pokrewieństwa-0 przy 25 markerach.

Based on a Genetic Distance of 0 at the Y-25 test
level, Patryk Mataliński and X are
estimated to share a common paternal line ancestor
who was, with a 95% probability, born between 1400
and 1950 CE. The most likely year is rounded to
1750 CE. This date is an estimate based on genetic
information only.
X has tested at Big Y, which is a more
detailed level than your Y-37. You can upgrade to
the same level to get a better time estimate.

Moje metrykalne drzewo sięga początku 18 wieku, wiec teoretycznie bardzo blisko tych wyliczeń. Zastanawiam sie czy jest jakaś metoda, żeby jeszcze bardziej sprecyzowac kiedy żył nasz wspólny przodek? Może Big Y cos pomoże.

sirdaniel - 27-09-2023 - 07:41
Temat postu:

Jesli ktos ma tylko poziom Y37, to dopasowanie GD 4 jest całkiem fajne.

Ale zobaczysz, że stanie się ono mało wiążące, gdy będziesz juz mial str111 i bigY. Bo GD4 przy str37 może naprawdę oznaczać nawet średniowiecze, więc daleko poza normalną genealogią.

To narzędzie do datowania jest przestarzałe. Możesz sobie ustalić w miarę jakis zakres przy STR111, ale realniejsze daty będą podawane przy porównaniu na drzewie (blocktree) BigY. No ale znów nie każdy z matchy zrobił BigY.

Po zrobieniu bigY dostaniesz fajne narzędzia i będziesz wtedy wiedział, że to o wiele wyższy poziom.

Sroczyński_Włodzimierz - 27-09-2023 - 10:58
Temat postu:

@ dystans 4 dla STR Y37
Nie sądzę by nowsze niż "przestarzałe"* dało wynik, który pozwoli na szacowanie "nie Średniowiecze", tj XVI wiek i później jako wartość szacowana.
Obecna podawana wartość (nie "nawet Średniowiecze" a - "dokładnie Średniowiecze", ok. 200 lat przed jego zakończeniem) raczej się obroni przy innych podejściach.
Co nie oznacza, że to bezużyteczne

* moim zdaniem: teraz jest zmodyfikowane na gorsze, tzn obecne, nowsze, "mniej przestarzałe" jest gorsze niż poprzedni widok

@ pełna zgodność na 25 STR
Taki wynik "szacowany wspólny przodek z 50% urodzony AD 1750 i później" daje realne szanse na powodzenie analizy przodków wg dokumentów. Niekoniecznie tylko tych występujących w wywodzie. Poszerzoną o informacje dotyczącą miejsc, migrację etc. Spora szansa na wytypowanie zbieżności. Oczywiście są olbrzymie różnice , nie każdy region, nie każda historia rodziny może być udokumentowana.

Łucja - 27-09-2023 - 13:32
Temat postu:

Mój Ojciec na poziomie Y37 i Y67 też ma GD = 4 ze swoim kuzynem, z którym mają wspólnego pradziadka, ich dziadkowie byli rodzeństwem. Czyli urodzeni w I poł. XX w. mają wspólnego przodka urodzonego na początku XIX w.

Łucja

Patrykmatal10 - 03-12-2023 - 00:13
Temat postu:

Witam ponownie. Dziś otrzymałem wynik Big Y test na familytreedna.com. Oto rezultat i ponownie mam kilka pytań.

R-M207>M173>M420>M459>M198>M417>PF6162>Z283>Z282>Z280>CTS1211>Y35>CTS3402>Y2364>Y33>CTS8816>Y2898>FGC11514>L1280>FGC19283>YP1448>FGC19270

1. Co mogę zrobić, żeby uzyskac dalsze mutacje? Czy wystarczy wgrać dane na www.yfull.com, tak jak mi wcześniej polecaliscie?

2.Big Y Raw Data-co w praktyce daje wykonanie tego testu?
opis testu-Można pobrać wyłącznie w formacie VCF lub BAM. Po zakończeniu realizacji transakcji plik surowych danych będzie dostępny do pobrania na stronie wyników Big Y. Pobieranie może zająć od 24 do 48 godzin.

Chodzi o to ,że bez pobrania tego pliku nie będę mógł wgrac z danych z testu Big Y na y-full? Czyli muszę najpierw zapłacić 100 usd za ten fomat VCF lub BAM a potem dodatkowo jeszcze 45 usd za wgranie danych na y-full ?

Z góry dziękuje za pomoc, Patryk